巴蜀学校创办于1933年，创建人乃原国民政府四川省主席王缵绪，它坐落于嘉陵江畔的张家花园，原是一所集幼稚园、小学、初中和高中于一体的闻名遐迩的私立学校。创建初期江苏教育家周勖成由黄炎培亲荐出任首任校长，卢作孚、康心如、何鲁等任校董，定下了“公正诚朴”校训,其意为：公而忘私，正大光明，诚实毋欺，朴实无华。1950年新中国解放后，由西南军政委员会接管，成为西南局干部子弟学校，邓小平同志亲口指示“一切不变，只许办好，不许办坏”。1954年西南大区撤销，学校交重庆教育局直管，1955年8月，巴蜀学校一分为三，中学部改为重庆市第41中学校。1991年更名为重庆市巴蜀中学校。
新世纪的巴蜀中学，学校有一个目光远大、思想先进、锐意改革、开拓创新的领导班子。1998年由时任校长傅唯泉创造性提出了核心办学理念：教育以人为本，校长以教师为本，教师以学生为本。他认为，实施素质教育的着眼点和归宿点都必须是“人”，必须是发现、挖掘学生潜能，注重学生人格塑造和情商开发，张扬人的个性的教育。“以人为本”不单是学校教育的根本，也是社会教育、家庭教育的根本。在此基础上，2010年，学校新任领导班子又深化提出了培养“善雅志”社会英才的德育理念——善为根，雅为骨，志为魂。善为根。善养于心，孝慈诚让；上善若水，厚德济生。善，乃立人之根本。雅为骨。雅修于情，高洁慧美；雅润如玉，君子淑女。雅，乃处世之风骨。志为魂。志立于行，坚韧精进；志比鸿鹄，胸怀天下。志，乃成才之魂魄。张扬个性，挖掘潜能，是巴蜀中学的办学特色。培养具有民族自尊心、民族自豪感的龙的传人，培养具有健康身心、健全人格的文明的人，培养勇于创新、善于学习的智慧的人，培养具有国际视野的开放的人，培养脚踏实地、勤奋实干的务实的人，这是我校的培养目标。
目前学校格局为一校四区：黄花园本部校区、鲁能巴蜀中学校区、金科巴蜀中学校区，龙湖巴蜀学校校区，总占地340亩，总建筑面积255601平方米，是全国中学办学规模最大的中学之一。
巴蜀中学是重庆市教委直属重点中学，北京大学首批校长实名推荐制中学，清华大学首批自主选拔“新百年领军计划”推荐资格中学，连续四届入选中国百强中学，2011年入选美国马里兰大学评选的中国高中五十强（第23名），全国现代教育技术实验学校，汉语国际推广中小学基地，全国国际象棋高水平后备人才培训基地，CCTV“最佳雇主”，中央人民广播电台“全国最具幸福感的学校”和“全国校园文化特色奖”,全国德育先进学校，全国艺术教育先进学校，全国奥林匹克教育示范学校，重庆市文明单位，影响重庆教育十大品牌中学，重庆市教育科研实验基地，重庆市民主管理示范学校。
